反滲透清洗劑只在清洗系統污染狀況，包括系統結垢，微生物污染及有機物顆粒附著等，目的是為了提高反滲透膜脫鹽率，降低一二段壓差，從而延長膜的使用壽命。

反滲透清洗劑的常見配方有：

配方1:2.0%（wt）檸檬酸（C6H8O7）的低pH清洗液（pH值為4.0）。對于去除無機鹽垢（如碳酸鈣垢、硫酸鈣、硫酸鋇、硫酸鍶垢等），金屬氧化物、氫氧化物（鐵錳、銅、鎳、鋁等），及無機膠體效果明顯。注意：此時應使用氨水調節pH值，因反應所形成的檸檬酸銨具有很好的螯合性，不能用氫氧化鈉調pH值。

配方2:2.0%（wt）STPP三聚磷酸鈉（Na5P3O10）和0.8%（wt）的Na2-EDTA混合的高pH清洗液（pH值為10.0）。它專用于去除硫酸鈣垢和輕微至中等程度的天然有機污染物。STP煙囪滑模P具有無機螯合劑和洗滌劑的功用。Na2-EDTA是一種具有螯合性很強的有機清洗劑可有效去除二價和三價陽離子和金屬離子。

配方3:1.0%（wt）亞硫酸氫鈉（Na2S2O4）的高pH清洗液（pH為11.5）。它用于去除金屬氧化物和氫氧化物，且可一定程度的擴展至去除硫酸鈣、硫酸鋇和硫酸鍶垢。亞硫酸氫鈉是強還原劑，能將污垢中的具有氧化性的物質還原并除去。

配方4:0.1%（wt）氫氧化鈉和0.03%（wt）SDS（十二烷基磺酸鈉）的高pH混合液（pH為11.5）。它用于去除天然有機污染物、無機/有機膠體混合污染物和微生物（菌素、藻類、霉菌、真菌）污染。SDS是會產生一些泡沫的陰離子表面活性劑型的洗滌劑。

配方5:0.1%（wt）氫氧化鈉高pH清洗液（pH為11.5）。它可用于去除聚合硅垢。此洗液是一種較為強烈的堿性清洗液。